Maintenant qu'une partition vierge est prête, le système de fichiers peut être créé. Le système le plus communément utilisé dans le monde Linux est le système de fichiers étendu, deuxième version, (plus connu sous son acronyme, ext2), mais avec les nouveaux disques haute capacité, les systèmes de fichiers journalisés deviennent de plus en plus populaires. Ici, nous créerons un système de fichiers ext2 mais les instructions de construction d'autres systèmes de fichiers sont disponibles dans http://www.linuxfromscratch.org/blfs/view/svn/postlfs/filesystems.html.
Pour créer un système de fichiers ext2 sur la partition LFS, lancez ce qui suit :
mke2fs /dev/[xxx]
Remplacez [xxx] avec le nom de la partition LFS
(hda5 dans notre exemple
précédent).
Si une partition de swap a été créée, elle devra aussi être initialisée en tant que partition de swap (connu aussi sous le nom de formatage, comme décrit ci-dessus avec mke2fs) en lançant ce qui suit. Si vous utilisez une partition de swap existante, il n'y a pas besoin de la formater.
mkswap /dev/[yyy]
Remplacez [yyy] avec le nom de la partition de
swap.